プレパラートで観察する試料が、血液や微生物などで薄切り処理を行わなくてもいい場合は、まずそれらの試料を観察に適した密度に希釈します。
そしてスライドグラスに希釈したものを塗りつけ、カバーガラスで覆うことでプレパラートを作成します。
非常に薄い試料（たとえば水草の非常に薄い葉など）を観察する場合には、柄付き針などで試料を広げます。
試料が透明であり見にくい場合には、染色を行い、見やすい状態とすることも多いです。