マイクロスコープは、顕微鏡部とコントローラ部で構成されています。

コントローラ部には、ディスプレイ、照明、パソコン・ソフトウェアなどが含まれ、顕微鏡部はレンズやカメラなどの部分を指します。

コントローラ部は従来、どうしても大きく、重くならざるを得なかったのですが、現在では手持ちのパソコンに直接つなぐことができるマイクロスコープも開発されています。

手持ちのパソコンに専用のソフトウェアをインストールすることで、コントローラ部の機能を手持ちのパソコンで賄うことができるようになり、マイクロスコープの持ち運びも便利になっています。