「メディアン」とは、「中央値」を表す言葉であり、メディアンフィルター処理は、ノイズ部分とそれを取り囲む画素の値の中央値を求め、中央値の画素でノイズ部分を置き換えるという処理のことを言います。

メディアンフィルター処理を行うと、移動平均フィルター処理に比べるとエッジがぼやけることのない画像が得られます。

どのような画像を得たいのか、何を観察するのかということによって、どちらの処理を行うのか選ぶことになります。